L’FSM non pubblica tariffe. I costi vengono negoziati prima dell'inizio della mediazione e sono inclusi nell'accordo di mediazione. La tariffa oraria varia tra i 150.– e 300.– CHF. È consuetudine che i costi siano ripartiti equamente tra le parti, si può eventualmente concordare una diversa ripartizione.  

Se i partecipanti dispongono di un'assicurazione di protezione giuridica, viene loro raccomandato di fare richiesta per la copertura dei costi. Nei casi che hanno per oggetto la protezione dei minori, le parti possono richiedere la mediazione gratuita se non dispongono dei mezzi economici necessari e se la mediazione è raccomandata da un tribunale. In alcuni cantoni, i costi della mediazione sono coperti dallo stato anche in altre situazioni.